实践中，但是由于法律规定不健全，法官对亲子鉴定的证据使用问题，常常感觉比较棘手，很多法官对亲子鉴定所持意见不一致，案件的处理结果也有所不同。

对于该鉴定结论的使用问题，出现两种不同的观点：一种观点认为，原告提交丙女与原告不具有亲生血缘关系的鉴定之证据，被告虽有异议，但并未提交证据予以反驳，根据谁主张谁举证的原则，被告应承担举证不能的后果，以此原告要求被告返还抚育费和赔偿精神损害抚慰金，应予支持;另一种观点认为，原告提交的检验意见书，非在诉讼中形成，被告又不予认可，且不具有排他性，故原告以与丙女不存在亲生血缘关系为由，要求丙女由被告抚养，原告不承担孩子的任何费用、返还原告抚养非婚生女的抚养费和入学费、赔偿精神损害抚慰金诉讼请求，不予支持。