一、配偶有生理缺陷是否属于离婚理由

　　《婚姻法》没有规定生理有缺陷的人不准结婚的条款，但夫妻共同生活的内容是各方面的，性生活是其中一部分的内容。

　　如果一方明知对方有生理缺陷不能发生性行为，而其它如性格，志趣都很情投意合，自愿结为夫妻，能在生活上互相照顾，法律仍保护这种婚姻关系。

　　但是，结婚时不知对方有生理缺陷，而且经过医治无效，导致感情破裂的，本人坚决要离婚，经调解无效，可以由人民法院判决离婚，这是符合《婚姻法》关于感情破裂，调解无效，应准予离婚的法律规定的。

　　二、分居两年能自动离婚吗

　　离婚的条件之一是“因感情不和分居满两年的，调解无效的。”这是指夫妻因分居而离婚的理由，这条法定的离婚理由由两个必备要件组成，缺一不可. 因此，分居两年并不会自动离婚。两个必须要件是：因感情不和;分居满两年的。

　　夫妻分居有两种类型：

　　第一种是因客观原因造成的，如夫妻俩分别在两个城市工作，没有同居的条件，这种夫妻分居的情形，不是因感情不和而分居，即是夫妻分居时间满两年也不符合“因感情不和分居”的法定提出离婚的理由。

　　第二种是主观原因造成的，如婚姻基础不牢固，婚后没有培养起夫妻感情而分居满两年的，符合“因感情不和分居”的法定离婚的理由。

　　分居时间应连续计算。因关于分居的举证比较困难，一般要双方共同认可。分居两年并不能自动离婚，它只是判断离婚的一个因素，离婚只有通过民政部门登记或者法院诉讼离婚才可以解除婚姻关系。

　　要是在结婚之后才发现配偶有生理缺陷的话，此时需要看具体的情况是怎样的，若生理缺陷已经严重影响到了夫妻婚后生活的，那此时可以构成离婚的理由。当然若对方的生理缺陷属于法定禁止结婚的疾病，则这样的婚姻也是会被认定为无效。