企业挂靠经营时控制法律风险的方式如下：

1、理清承包合同关系，切实将工程挂靠纳入企业内部承包体系企业内部全额风险承包的承包人，与工程挂靠下的承包人，在权利和义务方面没有实质性的区别。

2、整合企业组织结构，将确有实力且讲诚信的资本或项目的所有人纳入旗下，组建分公司，按照企业内部制度实施管理。以强化管理、控制风险。

3、在施工承包合同中约定：所有工程款必须进入施工企业指定账号，否则，视为发包人履行合同不符合合同约定。

4、加强财务监控，确保工程款不被挪作他用。

5、加强对承包人的授权管理和项目印章管理，限制直至禁止私自以项目部的名义对外签订合同。

6、设定担保为预防承包人无力或拒不承担亏损责任，企业可要求承包人选择下列形式的一种或几种，向企业提供担保：1)以自有或第三人资产设定抵押;2)找有实力的第三人提供保证;3)向企业缴纳履约保证金;4)银行出具保函。

7、保留合同解除权对企业来说保留合同解除权的意义在于取得主动，控制风险和损失进一步扩大。

【法律依据】

《合同法》第402条规定“受托人以自己的名义，在委托人的授权范围内与第三人订立的合同，第三人在订立合同时知道受托人与委托人之间的代理关系的，该合同直接约束委托人和第三人，但有确切证据证明该合同只约束受托人和第三人的除外。”